《植物生理学报》 2020, 56(4): 743-751

利用TRAP和SCAR标记评价铁皮石斛的遗传多样性与抗寒性

张君毅*, 吴永辉, 刘嘉, 秦建立, 张轶钧

华侨大学生物工程与技术系, 福建厦门361021

通信作者：张君毅；E-mail: zjy0054@163.com

摘　要：

开发目标区域扩增多态性(TRAP)和特异序列扩增区域(SCAR)标记, 对铁皮石斛(Dendrobium officinale)的3个生态类群46份种质进行遗传多样性评价、野生群体鉴别以及抗寒性筛选。以抗寒相关的CBF1/DREB1转录因子和钙依赖型蛋白激酶(CDPK1)基因设计TRAP固定引物, 从57对TRAP引物中共筛选出21个引物组合, 多态信息量(PIC)、分辨率(RP)和多态带百分比(PPB)平均分别为0.899、 2.054和76.79%。 Nei氏基因多样度(H)为0.217 7~0.291 7 (平均为0.258 1), Shannon信息指数(I)为0.325 1~0.442 1 (平均为0.389 2)。野生类群遗传多样性水平最高, 仿野生类群和栽培类群基本一致。主成分分析(PCA)结果表明供试材料可分为野生和栽培两大类群。此外, 开发了一个铁皮石斛转录因子(RAP2-4)的SCAR标记, 并以该SCAR标记和TRAP固定引物共同筛选出了核心抗寒种质资源。本文研究策略拟为TRAP标记在育种中的应用提供参考。

关键词：铁皮石斛; TRAP标记; 抗寒性; 遗传多样性; SCAR标记

收稿：2020-02-10   修定：2020-03-06

资助：福建省科技计划项目(2015N0028)